Sono stati prodotti anche alcuni brevi OAV di Fullmetal Alchemist.
Kids
Il primo di questi 4 OAV vede per poco più di tre minuti tre bambini molto somiglianti Alphonse, Edward e Winry da bambini correre per una città dei nostri tempi, per le cui strade compaiono manifesti del film. I tre bambini raggiungono la casa del bis-bis-nonno... non lo si vede in viso, ma ha un braccio meccanico... Lo stile dei personaggi è quello della prima serie animata.
Chibi Party
Il secondo di questi OAV dura più o meno sei minuti e vede molti dei personaggi della prima serie animata di Fullmetal Alchemist, riuniti per festeggiare "la fine delle riprese del film" Il conquistatore di Shamballa. E sono tutti disegnati in stile "chibi", cioè in versione super deformed, con tratti infantili e teste sproporzionate rispetto al corpo. Su questo sfondo prendono corpo una serie di simpatiche gag sul filo dell'assurdità e del non-sense, con una Riza Hawkeye più pazza che mai ed un Envy tenerissimo.
Alchimisti di stato contro homuncolus
L'esercito ha scoperto il nascondiglio degli homunculus e li sta per raggiungere. Nel frattempo Ed e Al si trovano già nel covo degli uomini artificiali, per salvare Winry rapita da Greed, o almeno è ciò che credono. Alla grande battaglia prenderà parte anche un giovane alchimista di stato appena arruolato, dalla cui visuale in prima persona verranno a momenti mostrate alcune scene. Lo stile dei personaggi è quello della prima serie animata.